O “CADDE Genomic Epidemiology Workshop” (2 a 6 de dezembro de 2019) é um curso prático de treinamento baseado na integração do sequenciamento Oxford Nanopore MinION com análise de dados genéticos para investigação de surtos. Pesquisadores que desejam treinamento em preparação de bibliotecas, execução do sequenciador MinION e análise de dados de sequenciamento usando ferramentas bioinformáticas e filogenéticas estão convidados a participar.
O “Oxford Nanopore MinION” é um sequenciador de DNA portátil capaz de produzir 20 Gbase de dados de sequência em tempo quase real. Este sistema foi usado para rastrear a propagação do Ebola na África Ocidental, monitorar o surto de Zika no nordeste do Brasil, o surto de febre amarela em Minas Gerais e, mais recentemente, a transmissão local do zika em Angola.
Usando novos protocolos desenvolvidos pelas equipes de projeto ZiBRA e CADDE, os pesquisadores agora podem gerar genomas de vírus em menos de 24 horas.
As vagas são limitadas e serão alocadas de acordo com os seguintes critérios: os candidatos devem ter experiência em biologia, saúde pública, bioinformática e /ou trabalho em laboratório úmido, além da disponibilidade para participar dos cinco dias do curso. Os candidatos deverão enviar uma declaração escrita e um resumo. Teremos um número limitado de vagas em nossa primeira edição. Os candidatos selecionados deverão apresentar um pôster em sua pesquisa. Oxford Nanopore Starter Packs estarão disponíveis para os pôsteres premiados.
Inscreva-se aqui: https://sistemas.imt.usp.br/workshop_cadde/
Inscrição até: 20 de Outubro 2019; Confirmação: 1 de Novembro 2019
Acesse o programa do curso aqui: https://sistemas.imt.usp.br/workshop_cadde/assets/cadde-workshop.pdf